本实用新型公开了一种移动式灭菌车间，包括物流车轨道、执行系统室和控制室；沿物流车轨道方向依次设有准备室、灭菌室和挥发室；执行系统室设有与准备室和灭菌室两者连接的加热加湿装置，设有与灭菌室连接的环氧乙烷供给装置，还设有与灭菌室和挥发室连接的无害化处理装置，所述执行系统室和控制室分别与准备室、灭菌室及挥发室通过管道连接和电性连接；所述物流车轨道上活动连接有物流车；执行系统室、控制室、准备室、灭菌室和挥发室设置在移动式箱体内。本实用新型提供的移动式灭菌车间，适用于野站医院或方舱医院等临时医疗卫生场所的消毒灭菌供应，机动灵活，反应迅速，可进行移动式流水线持续灭菌作业。