本实用新型公开了一种MEMS微镜的保护装置，包括微镜本体，所述微镜本体的底部设置有槽型固定板，所述微镜本体的外表面套接有盒体，所述微镜本体的表面设置有微镜镜头，所述盒体的顶部开设有开口，所述开口的内部固定连接有保护片，所述微镜镜头位于保护片的正下方，所述盒体的顶壁开设有两个防潮口，两个所述防潮口分别位于开口的两侧，两个所述防潮口的内部分别设置有防潮板，所述盒体的四个内侧壁分别开设有凹槽，所述凹槽的内部分别固定连接有多个第一弹簧。本实用新型盒体的设置，使其在运输和使用微镜本体及微镜镜头的过程中均可对其进行保护，并便于对其本体进行防潮、散热和防尘，以延长MEMS微镜的使用寿命。