本实用新型公开了一种生物质能反应器，包括外壳，所述外壳的右侧顶端开设有出水管，所述外壳的顶端开设有出气管，所述外壳的内部中间位置安装有驱动机构，所述第一转轴的外壁与转套的内壁滑动套接，所述转套的顶端与横梁的底端相固接，所述横梁通过轴承与第一转轴的顶端活动相连，是转套的外壁底端与横杆相固接。该生物质能反应器，通过电机、第一转轴、转套、横杆和横梁的配合，以实现对扰动机构的动力供给，再通过第一输出齿轮、第二输出齿轮、第二连接轴、第三输出齿轮和第二转轴的配合，实现对第二转轴的转动驱动，最终通过多个搅拌叶的转动，实现对外壳内进行扰动，极大的降低了堵塞现象的发生，使用方法简单，实用性强，便于推广。