本实用新型公开了一种双路隔仓结构滤波器，包括壳体，共模电感安装隔离仓中对应安装有共模电感，共模电感包括磁芯，磁芯中部设有隔离板，磁芯的第一绕线侧绕制有第一电感线，磁芯的第二绕线侧绕制有第二电感线；穿心电容安装隔离仓A中对应安装有穿心电容A，瓷介电容安装隔离仓A中对应安装有多层瓷介电容A；穿心电容安装隔离仓B中对应安装有穿心电容B，瓷介电容安装隔离仓B中对应安装有多层瓷介电容B。本实用新型内部电路采用新型的π型滤波电路，两路电源线的电感由一只共模电感来绕成，中间用隔离板将两组电源隔离开，不仅能在结构上抑制干扰的相互串扰，还能节省空间，在滤波电路上在低、中、高频上有很好的滤波效果。