本实用新型公开了一种丛枝菌根真菌分室培养苗木装置，包括培养盘，培养盘内开设有培养槽，培养槽内侧壁固定连接有培养板，培养板上开设有多个贯穿侧壁的种植口，种植口侧壁设置有夹持机构，位于培养板底部的培养槽侧壁固定连接有隔离板，位于隔离板底部的培养槽侧壁滑动连接有移动盘，移动盘上设置有供给机构，移动盘侧壁设置有调节机构。本实用新型通过在培养基底部设置有能进行移动的移动盘，通过控制移动盘将具有菌根真菌菌剂的液体输送到培养基底部，在移动盘上的吸水棉柱会实现对培养基水体的输送，从而直接对种植在培养基中的苗木根部进行补给真菌菌剂，并且实现持续不断较长时间的补给，保证苗木根部能受到菌根真菌侵染。