本实用新型提供一种汽车空调自动防霉系统，包括汽车本体，通过第一接收模块接收到车身主机发送的总线数据，然后将信号发送至微控制单元，通过微控制单元对接收到的数据进行分析，如果收到的是熄火命令，就会根据车身主机发送的数据判断熄火前空调冷凝器是否工作，如果熄火前空调冷凝器在工作，微控制单元会根据接收到的数据判断空调冷凝器的工作时长然后计算出风扇延时工作时间，以确保空调冷凝器温度迅速回升到室温，减少水汽凝结，减少霉菌等微生物繁殖，从而达到除菌和防止臭味的效果。因此，通过使用此汽车空调自动防霉系统，避免了频繁对空调进行拆洗，省时省力。且整个过程没有耗材，相对于除臭除味杀菌剂更环保，而且杀菌除臭效果更好。