本实用新型涉及水处理技术领域，公开了一种水箱自洁消毒器，解决了水箱中的水由于长期滞存，水质不同程度的受到病菌、微生物侵袭，以致储蓄在水箱中的水受到严重的污染的问题，包括消毒器本体与设置在消毒器本体内的电机、定量泵，消毒器本体包括消毒筒，消毒筒底部贯穿设置有旋转管，旋转管与消毒筒转动连接，且旋转管上固定有搅拌叶，并且旋转管的底端设置有底座；底座与旋转管转动配合，且底座上表面开设有凹槽，凹槽内固定有消毒管，消毒管上设置有喷头，由电机带动搅拌叶对水箱中的水进行搅动，减少水的沉淀现象，同时便于消毒液与水混合均匀，提高了对水的消毒效果，从而便于人们日常使用。