本实用新型公开一种卤虫分批次孵化及幼体自动分离装置，包括隔热桶，其顶端具有敞口结构、内部设置有加热组件、底部侧壁上设置有排水管；多个孵化桶，用于孵化卤虫；收集桶，用于收集卤虫，多个孵化桶沿收集桶的周向布置；充气增氧组件，包括充气源、置于收集桶和多个孵化桶内的气石以及连通在充气源与气石之间的充气管；每个孵化桶的孵化桶体与收集桶的收集桶体之间连接有供卤虫幼体通过的连通管道，收集桶体的内部、每个孵化桶体的内部以及连通管道的两端管口均设置有80目筛绢网层，收集桶盖的内侧壁以及每个孵化桶盖的内侧壁上均设置有诱导光源；收集桶体的底壁以及每个孵化桶体的底壁均设置出水孔，出水孔与排水管之间通过集水管相连通。