本实用新型公开了一种水中病原微生物分离提取装置，包括过滤箱、分离箱和反渗透膜，所述过滤箱上部一侧设置有进水管，所述过滤箱底部一侧设置有出水管，所述出水管中部设置有增压泵。有益效果在于：本实用新型通过设置固定板、安装槽、密封圈和管箍，能够使密封圈将反渗透膜固定在安装槽内，接着利用管箍将密封圈压紧，使密封圈不会在较大的压强下产生松动，此过程操作简单，大大节约了反渗透膜安装更换的时间，提高工作人员工作效率，通过设置控制器、加热器和温度传感器，能够在分离箱内的温度接近零度时，启动加热器，使分离箱内的温度始终保持在零度以上，进而不会损伤反渗透膜，降低使用成本。