本实用新型涉及一种生物催化反应器，包括依次连接的入口端壳体、加热反应器、电磁催化室、氧化定型室和物料出口端壳体，入口端壳体的中心设有物料和氧气入口，出口端壳体的中心设有物料出口；加热反应器、电磁催化室和氧化定型室均设为四方形箱形结构，加热反应器、电磁催化室和氧化定型室依次连接为隧道式密闭的整体四方形箱形结构；生物催化反应器还包括输送带，输送带传送的物料由物料和氧气入口进入，依次经过加热反应器、电磁催化室和氧化定型室，由物料出口输出。物料经生物催化反应器烘干、催化和氧化定型后之原料药分子的活性可被大幅提高，这样可大幅提高人体对药物分子的吸收效率，而且便于物料的保存，以及可避免物料的损耗。