本实用新型公开了微生物菌种振荡培养箱,包括外保护箱体，所述外保护箱体内底部中央的位置固定连接有中央支撑杆，所述中央支撑杆的侧面活动连接有中央支撑块，所述中央支撑块的上端面固定连接有中央振动电机。本实用新型，通过在菌种培养箱体水平和竖直两个方向上都设置振动电机，该振动培养箱既可以实现水平振荡又可以实现竖直振荡，在一定程度上提高了培养箱内微生物菌种的培养效率，通过在菌种培养箱体的上方设置有电动机带动的供氧搅拌棒，在培养过程中缓慢搅动培养液同时供氧一定氧气，维持培养液的氧气浓度，在一定程度上提升了散热效率，进而缩短了生物化肥的生产周期，提高了生产效率。