本实用新型公开了一种用于水质采样的防堵式负压抽取机构，包括有底座，底座上设有负压泵，负压泵的一端设有伸缩管，伸缩管的一端设置有防堵机构，防堵机构包括有安装壳，安装壳内设置有两组安装环，安装环内设有连接轴，连接轴的两端均设有三组粉碎刀；两组连接轴一端均设有第一传动齿轮，安装壳上开设有第二安装孔，第二安装孔内穿设有传动杆，传动杆的一端设置有第二传动齿轮同时与两组第一传动齿轮啮合，传动杆的另一端设有传动电机。该负压抽取机构结构简单，传动电机通电使两组连接轴转动，连接轴上的粉碎刀将水里的杂质粉碎，防止其进入负压泵时堵塞管道，防堵机构可进行拆卸，方便对其进行清洗，增加该负压抽取机构的使用寿命。