一种用于疫苗保护的温度调节系统，包括温度调节箱体、自动调节阀、控制器和温度传感器，所述自动调节阀、所述温度传感器分别与所述控制器连接，所述温度调节箱体内设有冷/热空气入口、常温空气入口以及与其连通的混合空气出风口，所述自动调节阀分别设置于所述冷/热空气入口、常温空气入口、混合空气出风口内，沿送风方向，所述温度传感器分别设置于自动调节阀前，所述控制器设置于所述温度调节箱体外，用于接收所述温度调节箱体内的混合温度、冷/热空气入口、所述常温空气入口的温度以及温度调节箱体内设定的温度信息，并控制所述自动调节阀的运行模式。本实用新型结构简单，实现自动恒温控制，进一步提高疫苗在转运或装卸过程的保护措施。