一种有机肥微生物发酵装置，包括固定板和发酵桶，发酵桶固定在固定板顶部的一端，发酵桶的顶端固定设有第一密封盖，第一密封盖的顶端设置有搅拌机构，搅拌机构包括慢速电机、第一齿轮、螺旋杆、防护罩、第二齿轮和固定杆，发酵桶一侧的顶端固定插接有自带电磁阀的入料口，发酵桶一侧的中部开设有开口，开口的一边侧铰接有箱门。本实用新型通过设有废水收集箱，这样发酵桶内部的废水会经过导水管排入到废水收集箱的内部被收集，最后再经排水管被排出到外设的收集处理装置里，这样将发酵桶内部的废水及时的排出，可以保证发酵桶内部有机肥的发酵不会受到废水的影响，进而可以提高发酵效果。