本实用新型公开一种药用洗瓶设备，包括输送机构、清洗驱动设备、清洗机构、输送轨道和旋转导轨，输送机构将正放在其上的药瓶沿预设输送方向输送至末端，清洗驱动设备包括具有安装腔室和清洗腔室的外壳和驱动组件，清洗机构设置在所述清洗腔室内，由所述驱动组件驱动上下往复运动，并向上喷发穿过外壳顶部的流射清洗液，输送轨道将输送至其上倒置的药瓶经过穿过外壳顶部的流射清洗液清洗后输送至尾端，旋转导轨两端分别与所述输送机构和所述输送轨道的头端转动连接，将输送机构尾端的药瓶旋转90°后滑落至输送轨道上，该种药用洗瓶设备能够对药品连续清洗，清洗质量高，药瓶污染程度小。