一种多段组合式农污处理系统，包括反应池单元、厌氧箱、缺氧箱、第一好氧箱、第二好氧箱及集水消毒箱；厌氧箱、缺氧箱、第一好氧箱、第二好氧箱及集水消毒箱从上到下依次部分地层叠设置；厌氧箱、缺氧箱、第一好氧箱、第二好氧箱的底部均设置有第一布水管，中部设置有生物膜反应层，侧壁于盖板与生物膜反应层之间穿设有出水管，前方的出水管与后方的第一布水管连接；厌氧箱、缺氧箱、第一好氧箱、第二好氧箱及集水消毒箱的顶部开口暴露的部分活动地覆盖有盖板，盖板上植有景观植物；第一好氧箱及第二好氧箱的底部分布有若干曝气盘，曝气盘通过供气管与一风机连接。如此模块化程度高、配置灵活、占地面积小且减少能源消耗。