本实用新型提供磁密封式玻璃化组织冷冻保存管，属于玻璃化组织保存技术领域，包括管体以及与管体可拆卸连接的盖体；管体内设有永磁体；盖体上设有中空腔体，中空腔体的一端封闭，另一端为喇叭状开口；中空腔体内放置有可与永磁体间产生吸力的球体；球体在永磁体吸力作用下将喇叭状开口堵住，使中空腔体与管体不连通；当球体克服吸力离开喇叭状开口，中空腔体与管体连通，中空腔体上设有与外界相通的泄压孔。本实用新型利用磁性吸引控制为玻璃化组织提供安全而稳定的密闭空间，保证管内组织与液氮在低温环境下的密封的同时，又可保证管内汽化氮的及时释放，实现了管内样本与外界环境的有效隔离，避免了管内气压升高造成的样本保存安全事故的发生。