本实用新型公开了一种防疫用公共卫生间消毒装置，涉及公共卫生间消毒技术领域，为解决消毒装置通常都是对地面进行消毒处理，而病毒细菌同样存在于空气中，在公共卫生间内的人员若是没有采取相应防疫措施，容易导致病毒细菌从呼吸道进入，从而对人的健康造成威胁，消毒装置的消毒效率不佳的问题。所述底座的上方设置有消毒柜，且消毒柜与底座通过螺钉连接，所述消毒柜的两端均设置有进气口，所述消毒柜的上端设置有排气口，所述排气口和进气口均与消毒柜设置为一体结构，所述排气口的一侧设置有开关按钮，所述排气口的下方设置有净化仓，所述净化仓的下方设置有风机，所述进气口的一侧设置有集风罩，所述风机的两侧均设置有导气管。