本实用新型公开了一种基于生物医药制备系统，包括安装架；所述安装架安装于底座的顶部；所述安装架的顶部安装有粉碎提升机构；所述粉碎提升机构底部安装有驱动机构；所述驱动机构的底部安装有粉碎桨；所述粉碎桨伸入一号粉碎箱内部；所述一号粉碎箱的底部通过电磁管连通二号粉碎箱；所述二号粉碎箱上设有分级粉碎机构；所述分级粉碎机构通过导管连通送料筒；所述送料筒内部设有螺旋绞龙；所述送料筒上对应螺旋绞龙设有驱动电机；所述二号粉碎箱安装于底座的顶部。本实用新型粉碎效果好，粉碎效率高，使用方便。