一种分析仪流通池冲洗控制系统，包括主管道，主管道上设有主管道调节阀，主管道上并联连接有旁路管，旁路管上设有分析仪传感器，分析仪传感器进液口一端设有冲洗法兰，冲洗法兰与清洁管连接，分析仪传感器出液口一端设有回收管，清洁管上设有工业冲洗水切断阀，回收管上设有放空回收切断阀，主管道调节阀调节主管道是否满管，从而调节旁路管内介质的流动，再辅以旁路进口切断阀和旁路出口切断阀的控制，得以方便控制介质流经分析仪传感器，在需要清洗时使旁路管内不被测介质流动，通过工业冲洗水切断阀向分析仪流通池内通入工业清洗水，可以在不干扰被测介质流动的情况下对分析仪流通池进行清洗，适合在化工领域推广使用。