本实用新型涉及水上育苗装置技术领域，具体为一种具有除垢结构的水上育苗装置，包括盘体，所述盘体的内壁前后两侧横向开设有第一滑槽，且第一滑槽内插设有第一滑块，所述第一滑块的左右两侧设置有第一凸块，且第一凸块卡合在第一凹槽内，所述第一凹槽对称开设在刷杆上，所述盘体的上端通过卡合机构连接有育苗盘，且育苗盘内等距设置有育苗槽，所述育苗槽内设置有排水孔。本实用新型通过设置刷杆，在使用本装置时，因刷杆的下端设置有刷毛，且刷毛与盘体的底部相贴合，在使用后可通过拉动刷杆，使得刷杆两端连接的第一滑块在第一滑槽内滑动，通过设置以上结构，提升了本装置清理时的便捷性，使得刷杆下端的刷毛可对盘体的底部进行清理。