本实用新型公开了一种小麦种子消毒装置，包括支撑架、磁铁和空气净化箱，所述支撑架上端设置有搅拌箱，所述搅拌箱上端一侧设置有进药斗，所述搅拌箱上端另一侧设置有端盖，所述端盖一侧设置有所述磁铁，所述搅拌箱上部一侧设置有出风管，所述出风管一侧设置有所述空气净化箱。有益效果在于：本实用新型通过设置端盖、保护壳、磁铁和干簧管，只有在端盖盖上后电机才能带动螺旋搅拌轴转动，不会导致工作人员受伤，提高了消毒装置的安全性能，通过设置出风管、空气净化箱和吸风机，能够吸收挥发的药液以及药液散发的气味，不会使这些气味扩散到周围的空气中，保护了工作人员的健康，提高了工作人员的工作效率。