本实用新型涉及厌氧发酵领域，提供了一种秸秆预处理系统，其特征在于，包括集成设置的运输部、处理部和控制部；运输部包括提升机和输送机，输送机用于水平传输待处理的秸秆包，提升机用以将秸秆包提升至顶部，并推送至处理部中；处理部包括密封舱，以及自上而下依次设于密封舱中的破包机、粉碎机和除杂机，破包机的进料口与提升机的出料口连接，除杂机的出料口处还连接有浸拌机；控制部分别与运输部和处理部信号连接。系统不仅高度集成占地面积小，而且可以自动化运行，并具有高效的秸秆预处理速度。