本实用新型公开了多仓压差过滤器，属于压差过滤器技术领域，包括基座，所述基座的顶面焊接分别有第一支腿，两组所述第一支腿的一端分别焊接于二级过滤罐体的底部，所述二级过滤罐体的内部安装有第二滤芯，所述二级过滤罐体的顶部通过连接管连接有一级过滤罐体，所述一级过滤罐体的内部安装有第一滤芯，所述基座的顶面分别焊接有第二支腿，两组所述第二支腿的一端分别焊接于箱体的底部，所述箱体的顶部安装有微生物培养箱，所述箱体的一侧焊接有支架，所述支架的一侧安装有电机。本装置实现两层过滤，过滤效果更好，稳定性更强，实用性更高，同时可以对过滤后的杂质或者污泥进行微生物除臭降解，减少二次污染的可能性。