本实用新型公开了一种医药学分离式配药装置，包括筒体，筒体内设有套筒，套筒的下端贯穿筒体的底部并于外界连通，筒体的下方设有底座，底座的上端设有限位凸台，筒体的下端设有限位凹槽，筒体与底座通过限位凸台和限位凹槽形成卡接，底座的上端中央嵌设有电机，套筒内竖直设有转轴，转轴的下端与电机的输出轴连接，筒体的上端螺纹连接有盖体，盖体的下端水平设有转盘，转盘的上端与盖体转动连接，转盘的下端设有卡槽，转轴的上端设有卡块，转盘与转轴通过卡槽和卡块形成卡接，转盘的下端设有搅拌棒，搅拌棍的上端均连接于转盘。本实用新型通过电机带动搅拌棒搅拌药物，再将搅拌混合均匀的药物倒出使用，在保证搅拌质量的同时也提高了实验效率。