本实用新型提供了一种能量转化生态厕所系统，涉及生态厕所的技术领域，解决了现有生态厕所因没有对大小便进行分离式发酵，和/或没有对发酵室进行较为持续地密封，从而使大小便不能进行充分地发酵、分解和资源转换的技术问题。该能量转化生态厕所系统包括外壳和内胆，内胆中空且内置于外壳；外壳设有马桶座以及用于开合马桶座开口的隔离装置；内胆依次设有具有进口的小便发酵室、大便输送装置和具有进口的大便发酵室，小便发酵室和大便发酵室分别预置发酵液；大便输送装置设置于大便发酵室进口一端；大便发酵室进口另一端设有密封止逆板。该能量转化生态厕所系统能使大小便分别发酵，而且使各自的发酵分解更充分，更有利于资源的转换利用。