本实用新型公开了药物分析用液质联用仪的流动相混匀装置，涉及药物分析用液质联用仪技术领域，为解决流动相混匀通常都是借助两个泵体将液料抽取注入到混合装置进行混合，由于两者液料的性质差异依靠自身进行混合效率不佳，在对一些精度需要较高时使用，混合的均匀性和效率就会影响药物分析的结果的问题。所述仪器固定座的上方设置有混均仓，且混均仓与仪器固定座通过螺钉连接，所述混均仓的上方设置有电机，且电机与混均仓通过螺钉连接，所述电机输出端的下方设置有转轴，所述转轴的一端贯穿并延伸至混均仓的内部，所述转轴的两侧均设置有搅拌叶，所述电机的两侧分别设置有第一液相管和第二液相管，所述混均仓的下方设置有出料管。