本实用新型公开了一种双工位自动化玻璃加工系统，包括机架、旋转电机、两个自动化玻璃加工装置，每个玻璃加工装置包括：夹持装置，包括夹紧机构和定位机构，夹紧机构沿旋转电机轴线设置在其一侧；定位机构位于夹紧机构下方；磨边装置，磨边装置包括第一和第二砂轮，第一砂轮能绕其自身轴线转动并能沿第一和第二方向往复移动，第一砂轮具有沿旋转电机轴线延伸的外圆加工部和倒角加工部，所述第二砂轮能绕其自身轴线转动并能沿第三方向往复移动，通过其端面对玻璃斜边进行加工。本实用新型至少包括以下优点：能够同时对双工位上玻璃加工，只需装夹一次，按工序依次研磨外圆、倒角及斜边，缩短研磨周期，提高工作效率，玻璃精准度高，人力成本降低。