本实用新型提供了一种魔芋种子消毒机，包括底座、设置在底座上的消毒罐以及进料器，底座包括支撑台、设置在支撑台底部的支撑脚以及对称设置在支撑台顶部两侧竖直支撑板，消毒罐为圆筒状结构且可转动夹设在两支撑板之间，消毒罐包括封闭式罐体和设置在罐体内部的种子容纳仓，种子容纳仓内部还设置有若干沿径向连接其内侧面与转动轴的分隔板，所述分隔板与种子容纳仓的侧面均为孔径小于种子的网状结构；本实用新型使得种子不会悬浮聚集到一起，更均匀的分散在消毒液中，充分进行杀菌消毒工作，在分隔之后通过转动进行搅拌，不会有搅拌叶之类尖锐锋利的部件撞击种子，从而保护了种子的完整性，不影响其后续的生长种植。