本实用新型提供一种生物工程废液分类收集箱，涉及生物工程领域。该生物工程废液分类收集箱,包括分离桶，分离桶的内部滑动连接有浮力机构，分离桶的顶端右侧固定固定安装有鼓风机构。该生物工程废液分类收集箱，废液在初始进入到分离桶的内部时，由于配重块的存在浮板不会在第一时间浮起，继续通入废液能够将浮板浮起，当液位恰好达到油脂出口底端时配重块与套环接触，此时能够通过风扇旋转将废液上表层的油脂通过油脂出口排出，当废液持续增多时液位上升能够将密封板带动抬升，实现排水，水量越大密封板抬起的高度约高，排水速度越快，进而能够保证油脂层能够较快的回到油脂出口的位置处,解决了现有技术中油脂与废液不分离导致堵塞管道的问题。