本实用新型公开了一种具有防异味结构的菌剂调配用搅拌装置，包括第一壳体，所述第一壳体的内部一侧螺纹连接有第一螺纹盖，所述第一螺纹盖的一侧焊接有第一盖板，所述第一螺纹盖的内部一侧开设有第二孔槽，所述第二孔槽的内部安装有电动机，所述电动机的输出轴贯穿第一螺纹盖；本装置在使用时，通过转动第二螺纹盖，使其从第一壳体中脱出，解除对连杆的位置固定，即可通过拉动连杆带动海绵块在第一壳体内运动，对第一壳体内部的残留物进行清理，防止第一壳体因残留物导致内部异味；本装置在使用时，通过设置第二橡胶圈配合第一橡胶圈增强连杆与第二螺纹盖和第二盖板的连接稳定性，防止连杆与第二盖板直接接触导致连杆被划损。