本实用新型提供的一种交替式冷却的冷却器水室，包括箱体，箱体内壁之间固定连接水平设置的隔板，隔板将箱体分隔成上层的第一腔体与下层的第二腔体，箱体上侧间隔固定连接两个气缸，每个气缸的活塞杆下端均装有冷却装置，隔板上设有两个通槽，每个通槽与每个冷却装置对应设置，两个冷却装置能够通过对应的通槽在第一腔体和第二腔体内交替运动，第二腔体两侧分别设有安装槽，每个安装槽内均固定连接冷风扇，第二腔体一侧设有进水孔，进水孔相对一侧设有出水孔。本实用新型提供的一种交替式冷却的冷却器水室，能够有效解决冷却器在长时间的工作过程中，冷却效果会逐渐减弱，导致冷却器的冷却效果变差的问题。