本实用新型涉及一种血管内皮细胞取样系统，包括输送鞘、导管和球囊，上述导管内部沿其长度方向设有相互独立的导丝腔和气体流腔，上述导管的一端设有与上述气体流腔连通的上述球囊，上述导管一端设有端部接头，该端部接头具有两个分别与上述导丝腔和气体流腔对应端连通的接口，上述导管置于上述输送鞘中，并可在外力作用下沿上述输送鞘推拉移动，并使上述球囊推出或缩回上述输送鞘端部，且当上述球囊推出上述输送鞘的端部后，上述球囊可充入空气膨胀，并在其表面形成用于在血管内获取内皮细胞的取样部。优点：结构设计简单、合理，能够有效的获取血管内皮细胞活检样，对于患者的病情评估有很大的助力作用，使得患者无法得到有效的治疗。