本实用新型公开了一种应用于电动闸门的防护机构，包括底座，所述闸门架顶部固定有防护箱，防护箱内壁顶部固定有轴承，轴承底部嵌套固定有第一直轴，第一直轴底部伸进闸门架内部，第一直轴圆周外壁固定有多个第一阻流板和第二阻流板，防护箱内壁顶部转动连接有第二直轴，第二直轴底部固定有风扇，第二直轴圆周外壁固定有多个第二支杆，第一直轴圆周外壁固定有多个第一支杆，第一支杆和第二支杆外侧均固定有撞击块。本实用新型中，进行泄洪时，水流带动第一阻流板和第二阻流板转动，继而带动第一直轴转动，使得第一支杆和撞击块转动，撞击并带动第二支杆和风扇转动，从而利用水能转化成风能，对防护箱内进行除湿，降低传动组件的侵蚀。