本实用新型公开了一种生物酶自清洁防堵塞过滤装置，其包括：支架、筒体、活塞板和滤板，所述筒体设置在支架顶部，所述滤板同心设置在筒体中，所述筒体一侧或者活塞板上设置有位于滤板位置上方的进液管接头，所述筒体顶部设置有盖板，所述盖板上设置有延伸至下方的升降驱动装置，所述活塞板设置在筒体中并与升降驱动装置底部相连接，所述滤板上设置有数个过滤孔，所述活塞板底部设置有与过滤孔一一对应的插针。本实用新型所述的生物酶自清洁防堵塞过滤装置，通过活塞板的下压使得生物酶混合溶液快速通过过滤孔而向下流动，提升了过滤效率，活塞板每次下压时利用插针插入过滤孔，从而实现了过滤孔的自动清洁。