本实用新型公开了一种菌种接种集中处理中心的混料机构，包括上机体和下机体，上机体的顶部密封连接有一顶盖，顶盖上设有搅拌轴驱动电机和菌种储存盒，上机体内转动连接有一搅拌轴，上机体的上端四周阵列有多个接口，各接口倾斜固定有一连接管，各连接管倾斜向上设置，上机体的底部还转动连接有两片底盖，两底盖的底部分别与一气缸的活塞杆相连接，上机体和下机体密封连接，下机体内设有一喇叭状的导出口，还包括一螺旋式输送机，螺旋式输送机的入口端位于导出口的正下方，本实用新型主要解决了多台上游设加工备与混料机构和下游加工设备的衔接问题，以及衔接过程中可能产生二次污染的问题。