本实用新型涉及一种仪器泡沫垫定位辅助装置，包括支撑座、安装在支撑座上的竖向压紧机构和导向定位机构，所述支撑座固定在切割设备的机床上，所述竖向压紧机构靠近切割设备上的切刀位置设置，所述导向定位机构位于竖向压紧机构远离切刀的一侧，所述竖向压紧机构包括横板、气缸、压头。本实用新型通过竖向压紧机构的设置，压头在气缸的驱动下能够压紧待裁切的仪器泡沫垫，从而保证了在切割仪器泡沫垫时，仪器泡沫垫不发生移动，切割更加精准，并且左压块和右压块相对上板可以移动，使其之间的距离可以调节，因此可以压紧不同宽度的仪器泡沫垫，适应范围更广。