本申请涉及一种多库温空调系统，用于舰船冷库，它包括高温冷风机、低温冷风机、压缩机、冷凝器、热力膨胀阀、蒸发压力调节阀、干燥过滤器和气液分离器。所述高温冷风机和低温冷风机上均设置有制冷剂流入口和制冷剂流出口；所述气液分离器、压缩机、冷凝器、干燥过滤器依次串联连接；所述高温冷风机和低温冷风机的制冷剂流入口均设置有截止阀和所述热力膨胀阀；所述高温冷风机的制冷剂流出口设置有所述蒸发压力调节阀和截止阀；所述低温冷风机的制冷剂流出口与截止阀连接。本空调系统通过一台压缩冷凝机组，带动多个不同蒸发温度的冷风机，以实现对多个冷库不同库温的同时控制。