本实用新型提供一种用于医药筛选的生物芯片杂交盒装置，涉及生物芯片杂交技术领域，以解决现有的生物芯片杂交盒，生物芯片进行杂交的过程中，由于需要把生物芯片放在杂交盒内完成相互之间的杂交，如果用手拿取生物芯片来相互进行杂交，手部触碰生物芯片时，可能会把手部的细菌感染生物芯片，因此生物芯片上的杂交液会产生控制范围之外的变化，易导致生物芯片之间的杂交失败，不仅浪费时间还造成了经济损失的问题，包括盒体；所述盒体顶部平面的中部固定安装一个矩形的固定框。本实用新型中把抽筒内部吸附的生物芯片推到承载座上，操作过程中不用手触碰生物芯片，还能在密封状态下完成，也同时避免了空气中的细菌杂质与生物芯片发生反应。