本实用新型公开了一种微型多波长滤光系统模块，所述模块包括：滤光滑片，所述滤光滑片上设有光源滤光片和接收光滤光片；滑槽，所述滑槽设置于所述滤光滑片的上下两侧，所述滤光滑片与滑槽活动连接；侧限位密封板，所述滑槽的两侧分别与两个侧限位密封板相接。通过本实用新型微型多波长滤光系统模块的结构设计，能满足多个波长通道要求，又能做到足够小巧，甚至能做到手持设备中。