本实用新型涉及一种微藻光自养异养耦合装置，其主体为罐体，罐体设有不透光的内腔和透光的外腔，罐体的内腔和外腔底部均设有带阀门的出料口，罐体的内腔和外腔各自顶部均设有进气孔和出气孔，以及带阀门的进料口，内腔的进气孔内密封插入延伸至内腔底部的进气管，进气管外接供气机的排气口；内腔的出气孔密封连接导管，导管沿所述外腔顶部的进气孔密封插入并伸入至外腔底部，外腔的排气口密封连接排气管，排气管连接所述供气机的进气口；所述罐体的顶部固定连接电机，电机连接转轴，转轴密封伸入所述内腔并固定连接搅拌叶片。通过上述结构，实现了微藻光自养与异养耦合在同一个生物反应器内，降低整个微藻的生长成本，提高生长效率。