本实用新型涉及啮齿类动物实验装置技术领域，用于避免外界环境中的微生物对实验动物的污染，具体涉及一种啮齿类实验动物换笼隔离器，包括连接在底座上的废弃垫料收集系统和排风系统，排风系统上连接有控制面板，排风系统和废弃垫料收集系统上方连接换笼操作腔，换笼操作腔两侧均连接有传递窗，换笼操作腔内部连接有操作手、照明灯和紫外灭菌灯，换笼操作腔上方连接有进风系统；解决了现有技术中对IVC笼盒进行换笼操作时存在被外界环境微生物污染及污染外界环境的问题，通过使用该换笼隔离器，使工作人员在换笼操作时既能避免被外界环境中的微生物污染，也能减少在换笼过程中产生的污染物对外界环境造成污染的问题，实现了对外界环境的保护。