本实用新型公开了医疗设备定位系统，包括箱体和顶盖，所述箱体的外侧开设有第一凹槽，且第一凹槽的内部设置有橡胶垫，所述箱体的内部开设有安装槽，且安装槽的内部设置有防护垫，所述防护垫的内部安装有GPS定位器，所述箱体通过连接座与盖壳相连接，且盖壳的下端外侧开设有存放槽，所述存放槽的内部安装有密封垫，所述盖壳的外侧开设有第二凹槽，所述顶盖位于盖壳的上端，所述箱体的下端设置有吸盘。该医疗设备定位系统，与现有的普通医疗定位系统相比，增加结构的同时大大提高了整个医疗定位系统的使用性能，改良后的医疗定位系统内部拥有定位结构，并且便于与医疗设备安装和拆卸结构，有效满足了人们的使用需求。