本实用新型公开了一种土壤分层取样的控制系统，包括电控单元、监测单元和执行单元，所述电控单元包括电池、控制器、减速电机和操作板，所述操作板的输出端与控制器的输入端相连接，所述控制器的输出端与减速电机的输入端相连接，所述监测单元由距离传感器和线束组成，所述距离传感器通过线束与控制器相连接，所述减速电机的输出端与执行单元相连接，本土壤分层取样的控制系统通过操作板设定深度后，在控制器和距离传感器的作用下，准确的控制取样深度，同时该装置采用内外杆相结合的结构，可以有效保证取样纯度。