本实用新型涉及农业育苗培育技术领域，尤其为一种内加热小样染色装置，包括底座、控制箱体和小样染色箱体以及顶箱，所述底座的右侧设有电源接口，所述底座的顶部从左至右依次安装有控制箱体与小样染色箱体，所述控制箱体的基面嵌入安装有控制器面板，所述小样染色箱体的内部从上至下依次设有第一染色仓与第二染色仓，所述第一染色仓与第二染色仓的基面均安装有仓门，所述仓门的基面上嵌入安装有观察窗，整体装置结构简单，具备双仓同步多组不同小样染色使用操作，提高打样染色效率，便于染色剂和待染色小样转动均匀混合着色使用，同时便于精准控温加热，使得染色小样的染色均匀和染色牢固性好，且稳定性和实用性较高，具有一定的推广价值。