本实用新型涉及变频控制技术领域，公开了一种离心机变频控制系统，包括电源模块、主控模块和功率驱动模块，电源模块包括整流桥，整流桥的输入侧电连接有EMC电路，所述整流桥的输出端电连接有DC/DC转换电路；主控模块的输出三相控制信号至功率驱动模块，功率驱动模块输出经过变频处理的三相驱动电流至离心机电机，功率驱动模块的输出端还电连接有采样电阻，采样电阻与电流采样电路电连接。实用新型中采用主控模块和功率驱动模块实现了离心机的变频控制，与常规的离心机变频控制相比，电路集成化程度高，外部接线少便于走线和维护。