本实用新型公开了一种水文地质钻孔抽水止水器，包括钻杆、第一水管、伸缩软管、第二水管和防水微型双轴马达，所述钻杆的顶端设置有第一水管，且第一水管的外侧面一体式连接有第一安装板，所述第一水管的下表面固定连接有伸缩软管，所述钻杆的底端固定有防水微型双轴马达，且防水微型双轴马达的输出端固定连接有丝杆，所述丝杆的外侧螺纹连接有推板的底端，且推板的外侧面固定有堵塞块，所述钻杆的左右两端均开设有进水口，且进水口的外端安装有塑料过滤板，所述钻杆的顶端外侧面焊接有第二安装板。该水文地质钻孔抽水止水器，便于清理塑料过滤板，通过堵塞块的移动控制进水口的开合，便于止水，提高连接结构稳定性。