本实用新型公开了一种药学实验专用配药器，包括锥形玻璃瓶，所述锥形玻璃瓶的上表面设置有密封盖，所述密封盖的上表面开设有三个通孔，三个所述通孔的内壁分别固定连接有固态配药管、液态配药管和通气管，所述密封盖的上表面固定安装有微型马达，所述密封盖的正面分别设置有电池盒和开关按钮，所述微型马达的输出端延伸至锥形玻璃瓶的内部，所述微型马达的输出端固定安装有凹型槽块，所述凹型槽块的内壁插接有转动轴。该药学实验专用配药器，通过设置微型马达、转动轴和硅胶搅拌叶，能够利用微型马达带动转动轴上的搅拌叶转动，加快各种药液的混合，相比较于人工晃动锥形玻璃瓶，药液混合的更加均匀，且更加省力，提高了药学实验的效率。