本实用新型公开了一种全自动生化分析仪的采样机构，包括设于生化分析仪本体上的采样机构，还包括设置在采样机构上的防护装置，所述采样机构包括外框体和连接在外框体与分析仪本体之间的伸缩支杆，所述外框体上安装有采样针，所述采样针贯穿并上下滑动设置于防护装置中；所述防护装置包括两端开口的圆筒状的固定框和内框，所述内框贯穿固定框并与固定框螺纹连接，所述内框中用于采样针贯穿的通槽的槽壁上设有吸水层；该全自动生化分析仪的采样机构，在采样针的外部设置有防护装置，吸水层包裹贴合在采样针的外部，采样针上下移动采样时，其表面也在吸水层中上下摩擦，使得吸水层能够将采样针上残留的液体吸附并且擦除。