一种隔离器清洗管理系统，隔离器包括多个隔离器腔体，隔离器腔体内设有隔离器竖风管和隔离器横风管，清洗管理系统包括灭活液管路、清洗液管路、压缩空气管路、介质输入管路和介质排出管路，灭活液管路、清洗液管路和压缩空气管路均与介质输入管路连通，介质输入管路上设有第一清洗管路和第二清洗管路，第一清洗管路包括第一开关阀以及设于隔离器竖风管内的第一清洗部件，第二清洗管路包括第一开关阀以及设于隔离器横风管内的第二清洗部件，每一组相互连通的隔离器竖风管和隔离器横风管通过一第二开关阀与介质排出管路连通。一种隔离器，包括上述的隔离器清洗管理系统。本实用新型具有结构简单、可实现分段清洗、减少介质瞬时耗量和排放量等优点。